Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PLTPP55058 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PLTPP55058 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PLTPP55058 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PLTPP55058 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLTPP55058 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PLTPP55058 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLTPP55058 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PLTPP55058 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLTPP55058 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLTPP55058 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PLTPP55058 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLTPP55058 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PLTPP55058 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PLTPP55058 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLTPP55058 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PLTPP55058 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PLTPP55058 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLTPP55058 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLTPP55058 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PLTPP55058 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PLTPP55058 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLTPP55058 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLTPP55058 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLTPP55058 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PLTPP55058 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLTPP55058 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PLTPP55058 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PLTPP55058 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLTPP55058 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLTPP55058 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLTPP55058 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLTPP55058 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PLTPP55058 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLTPP55058 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLTPP55058 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PLTPP55058 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLTPP55058 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLTPP55058 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PLTPP55058 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLTPP55058 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLTPP55058 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PLTPP55058 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLTPP55058 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLTPP55058 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PLTPP55058 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PLTPP55058 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
PLTPP55058 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLTPP55058 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PLTPP55058 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PLTPP55058 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLTPP55058 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLTPP55058 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PLTPP55058 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PLTPP55058 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PLTPP55058 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PLTPP55058 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PLTPP55058 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLTPP55058 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLTPP55058 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PLTPP55058 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLTPP55058 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLTPP55058 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PLTPP55058 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PLTPP55058 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PLTPP55058 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLTPP55058 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PLTPP55058 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLTPP55058 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLTPP55058 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
PLTPP55058 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLTPP55058 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PLTPP55058 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLTPP55058 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PLTPP55058 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLTPP55058 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLTPP55058 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PLTPP55058 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PLTPP55058 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PLTPP55058 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLTPP55058 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PLTPP55058 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
PLTPP55058 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLTPP55058 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PLTPP55058 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PLTPP55058 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PLTPP55058 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PLTPP55058 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLTPP55058 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLTPP55058 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PLTPP55058 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
PLTPP55058 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PLTPP55058 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLTPP55058 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PLTPP55058 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PLTPP55058 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PLTPP55058 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLTPP55058 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PLTPP55058 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PLTPP55058 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms