Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD23BP54727 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RAD23BP54727 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD23BP54727 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD23BP54727 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RAD23BP54727 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RAD23BP54727 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RAD23BP54727 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RAD23BP54727 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RAD23BP54727 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD23BP54727 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RAD23BP54727 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RAD23BP54727 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD23BP54727 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RAD23BP54727 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RAD23BP54727 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RAD23BP54727 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RAD23BP54727 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RAD23BP54727 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms