Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP12AP54707 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP12AP54707 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP12AP54707 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP12AP54707 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP12AP54707 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP12AP54707 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP12AP54707 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
ATP12AP54707 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP12AP54707 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP12AP54707 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATP12AP54707 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATP12AP54707 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms