Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RABGGTBP53611 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RABGGTBP53611 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RABGGTBP53611 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.88■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RABGGTBP53611 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RABGGTBP53611 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
RABGGTBP53611 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
RABGGTBP53611 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
RABGGTBP53611 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RABGGTBP53611 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
RABGGTBP53611 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
RABGGTBP53611 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RABGGTBP53611 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
RABGGTBP53611 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RABGGTBP53611 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RABGGTBP53611 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
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