Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CAPZA1P52907 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAPZA1P52907 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAPZA1P52907 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CAPZA1P52907 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CAPZA1P52907 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CAPZA1P52907 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CAPZA1P52907 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CAPZA1P52907 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms