Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KPNA1P52294 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KPNA1P52294 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
KPNA1P52294 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
KPNA1P52294 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KPNA1P52294 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KPNA1P52294 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KPNA1P52294 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
KPNA1P52294 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
KPNA1P52294 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms