Protein–RNA interactions for Protein: P51946

CCNH, Cyclin-H, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNHP51946 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNHP51946 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNHP51946 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCNHP51946 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNHP51946 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNHP51946 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNHP51946 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNHP51946 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNHP51946 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNHP51946 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNHP51946 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNHP51946 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNHP51946 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNHP51946 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNHP51946 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNHP51946 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNHP51946 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNHP51946 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNHP51946 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNHP51946 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNHP51946 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNHP51946 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNHP51946 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNHP51946 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNHP51946 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNHP51946 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNHP51946 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNHP51946 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNHP51946 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNHP51946 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNHP51946 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNHP51946 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNHP51946 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNHP51946 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNHP51946 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNHP51946 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNHP51946 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNHP51946 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNHP51946 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCNHP51946 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNHP51946 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCNHP51946 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCNHP51946 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCNHP51946 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNHP51946 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNHP51946 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNHP51946 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCNHP51946 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNHP51946 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCNHP51946 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNHP51946 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNHP51946 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNHP51946 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCNHP51946 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNHP51946 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCNHP51946 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCNHP51946 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCNHP51946 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNHP51946 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNHP51946 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCNHP51946 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNHP51946 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCNHP51946 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNHP51946 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCNHP51946 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNHP51946 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNHP51946 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCNHP51946 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCNHP51946 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNHP51946 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCNHP51946 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCNHP51946 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNHP51946 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCNHP51946 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNHP51946 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCNHP51946 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CCNHP51946 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNHP51946 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNHP51946 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNHP51946 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCNHP51946 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNHP51946 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNHP51946 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CCNHP51946 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNHP51946 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNHP51946 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCNHP51946 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNHP51946 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CCNHP51946 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCNHP51946 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCNHP51946 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCNHP51946 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNHP51946 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCNHP51946 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNHP51946 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNHP51946 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCNHP51946 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNHP51946 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNHP51946 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCNHP51946 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms