Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLCNKBP51801 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CLCNKBP51801 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CLCNKBP51801 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CLCNKBP51801 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CLCNKBP51801 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCNKBP51801 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCNKBP51801 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CLCNKBP51801 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCNKBP51801 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLCNKBP51801 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCNKBP51801 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCNKBP51801 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCNKBP51801 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCNKBP51801 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCNKBP51801 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms