Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLCN6P51797 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CLCN6P51797 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CLCN6P51797 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CLCN6P51797 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLCN6P51797 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CLCN6P51797 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
CLCN6P51797 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CLCN6P51797 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN6P51797 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLCN6P51797 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLCN6P51797 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CLCN6P51797 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLCN6P51797 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CLCN6P51797 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN6P51797 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN6P51797 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CLCN6P51797 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms