Protein–RNA interactions for Protein: P51511

MMP15, Matrix metalloproteinase-15, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP15P51511 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MMP15P51511 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP15P51511 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MMP15P51511 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP15P51511 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MMP15P51511 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP15P51511 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP15P51511 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP15P51511 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MMP15P51511 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP15P51511 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP15P51511 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP15P51511 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MMP15P51511 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MMP15P51511 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MMP15P51511 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP15P51511 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MMP15P51511 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP15P51511 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MMP15P51511 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP15P51511 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP15P51511 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP15P51511 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MMP15P51511 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP15P51511 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MMP15P51511 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MMP15P51511 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MMP15P51511 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP15P51511 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP15P51511 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MMP15P51511 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MMP15P51511 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP15P51511 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP15P51511 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MMP15P51511 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP15P51511 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP15P51511 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP15P51511 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
MMP15P51511 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP15P51511 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
MMP15P51511 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP15P51511 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
MMP15P51511 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP15P51511 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MMP15P51511 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP15P51511 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP15P51511 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MMP15P51511 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP15P51511 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP15P51511 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MMP15P51511 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP15P51511 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MMP15P51511 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MMP15P51511 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMP15P51511 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MMP15P51511 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP15P51511 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MMP15P51511 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP15P51511 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP15P51511 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP15P51511 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP15P51511 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP15P51511 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MMP15P51511 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP15P51511 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP15P51511 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MMP15P51511 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP15P51511 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MMP15P51511 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MMP15P51511 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MMP15P51511 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP15P51511 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP15P51511 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MMP15P51511 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MMP15P51511 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP15P51511 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MMP15P51511 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP15P51511 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP15P51511 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP15P51511 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MMP15P51511 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP15P51511 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MMP15P51511 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP15P51511 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP15P51511 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MMP15P51511 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP15P51511 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MMP15P51511 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP15P51511 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MMP15P51511 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MMP15P51511 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP15P51511 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP15P51511 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MMP15P51511 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP15P51511 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MMP15P51511 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP15P51511 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP15P51511 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MMP15P51511 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MMP15P51511 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms