Protein–RNA interactions for Protein: P48594

SERPINB4, Serpin B4, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB4P48594 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SERPINB4P48594 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SERPINB4P48594 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SERPINB4P48594 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SERPINB4P48594 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SERPINB4P48594 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SERPINB4P48594 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SERPINB4P48594 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SERPINB4P48594 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINB4P48594 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SERPINB4P48594 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SERPINB4P48594 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SERPINB4P48594 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms