Protein–RNA interactions for Protein: P48544

KCNJ5, G protein-activated inward rectifier potassium channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNJ5P48544 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KCNJ5P48544 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ5P48544 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KCNJ5P48544 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ5P48544 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ5P48544 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KCNJ5P48544 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KCNJ5P48544 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ5P48544 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ5P48544 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KCNJ5P48544 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KCNJ5P48544 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KCNJ5P48544 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCNJ5P48544 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ5P48544 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ5P48544 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
KCNJ5P48544 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCNJ5P48544 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNJ5P48544 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNJ5P48544 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNJ5P48544 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms