Protein–RNA interactions for Protein: P47992

XCL1, Lymphotactin, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL1P47992 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
XCL1P47992 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XCL1P47992 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
XCL1P47992 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XCL1P47992 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
XCL1P47992 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL1P47992 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
XCL1P47992 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCL1P47992 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
XCL1P47992 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
XCL1P47992 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
XCL1P47992 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
XCL1P47992 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL1P47992 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL1P47992 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL1P47992 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL1P47992 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
XCL1P47992 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XCL1P47992 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XCL1P47992 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
XCL1P47992 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL1P47992 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL1P47992 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL1P47992 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
XCL1P47992 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL1P47992 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL1P47992 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL1P47992 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
XCL1P47992 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCL1P47992 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
XCL1P47992 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCL1P47992 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
XCL1P47992 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
XCL1P47992 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XCL1P47992 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
XCL1P47992 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
XCL1P47992 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL1P47992 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL1P47992 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
XCL1P47992 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XCL1P47992 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
XCL1P47992 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
XCL1P47992 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XCL1P47992 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
XCL1P47992 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
XCL1P47992 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL1P47992 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL1P47992 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
XCL1P47992 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
XCL1P47992 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
XCL1P47992 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL1P47992 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
XCL1P47992 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL1P47992 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XCL1P47992 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XCL1P47992 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL1P47992 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL1P47992 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL1P47992 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL1P47992 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XCL1P47992 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL1P47992 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL1P47992 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XCL1P47992 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL1P47992 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL1P47992 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL1P47992 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
XCL1P47992 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XCL1P47992 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XCL1P47992 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
XCL1P47992 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
XCL1P47992 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL1P47992 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL1P47992 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL1P47992 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL1P47992 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL1P47992 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
XCL1P47992 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
XCL1P47992 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
XCL1P47992 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL1P47992 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL1P47992 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
XCL1P47992 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL1P47992 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL1P47992 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
XCL1P47992 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL1P47992 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL1P47992 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
XCL1P47992 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL1P47992 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL1P47992 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL1P47992 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
XCL1P47992 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL1P47992 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL1P47992 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL1P47992 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL1P47992 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
XCL1P47992 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XCL1P47992 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
XCL1P47992 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms