Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEDD4P46934 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEDD4P46934 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NEDD4P46934 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
NEDD4P46934 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
NEDD4P46934 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NEDD4P46934 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NEDD4P46934 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NEDD4P46934 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
NEDD4P46934 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
NEDD4P46934 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
NEDD4P46934 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
NEDD4P46934 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NEDD4P46934 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NEDD4P46934 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NEDD4P46934 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NEDD4P46934 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NEDD4P46934 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NEDD4P46934 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
NEDD4P46934 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms