Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACADSBP45954 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACADSBP45954 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACADSBP45954 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACADSBP45954 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ACADSBP45954 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ACADSBP45954 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ACADSBP45954 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACADSBP45954 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACADSBP45954 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACADSBP45954 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ACADSBP45954 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ACADSBP45954 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ACADSBP45954 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms