Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LPAR6P43657 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LPAR6P43657 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
LPAR6P43657 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LPAR6P43657 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
LPAR6P43657 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LPAR6P43657 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LPAR6P43657 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms