Protein–RNA interactions for Protein: P40939

HADHA, Trifunctional enzyme subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHAP40939 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HADHAP40939 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HADHAP40939 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HADHAP40939 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HADHAP40939 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HADHAP40939 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HADHAP40939 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HADHAP40939 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HADHAP40939 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HADHAP40939 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HADHAP40939 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HADHAP40939 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HADHAP40939 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HADHAP40939 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
HADHAP40939 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HADHAP40939 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
HADHAP40939 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HADHAP40939 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HADHAP40939 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HADHAP40939 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HADHAP40939 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HADHAP40939 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HADHAP40939 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HADHAP40939 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HADHAP40939 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HADHAP40939 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HADHAP40939 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HADHAP40939 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HADHAP40939 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHAP40939 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHAP40939 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHAP40939 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHAP40939 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HADHAP40939 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HADHAP40939 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HADHAP40939 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHAP40939 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HADHAP40939 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HADHAP40939 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HADHAP40939 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HADHAP40939 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HADHAP40939 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HADHAP40939 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HADHAP40939 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HADHAP40939 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HADHAP40939 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HADHAP40939 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HADHAP40939 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HADHAP40939 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HADHAP40939 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HADHAP40939 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HADHAP40939 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HADHAP40939 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHAP40939 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHAP40939 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HADHAP40939 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HADHAP40939 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HADHAP40939 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HADHAP40939 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HADHAP40939 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
HADHAP40939 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HADHAP40939 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHAP40939 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHAP40939 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHAP40939 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHAP40939 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HADHAP40939 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHAP40939 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HADHAP40939 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HADHAP40939 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HADHAP40939 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HADHAP40939 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HADHAP40939 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HADHAP40939 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HADHAP40939 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HADHAP40939 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HADHAP40939 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HADHAP40939 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HADHAP40939 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HADHAP40939 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HADHAP40939 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HADHAP40939 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HADHAP40939 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HADHAP40939 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HADHAP40939 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHAP40939 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHAP40939 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHAP40939 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHAP40939 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHAP40939 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HADHAP40939 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHAP40939 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHAP40939 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HADHAP40939 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHAP40939 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHAP40939 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHAP40939 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HADHAP40939 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
HADHAP40939 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms