Protein–RNA interactions for Protein: P39748

FEN1, Flap endonuclease 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FEN1P39748 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FEN1P39748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FEN1P39748 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FEN1P39748 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FEN1P39748 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FEN1P39748 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FEN1P39748 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FEN1P39748 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FEN1P39748 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FEN1P39748 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
FEN1P39748 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FEN1P39748 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
FEN1P39748 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FEN1P39748 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FEN1P39748 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FEN1P39748 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FEN1P39748 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FEN1P39748 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FEN1P39748 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FEN1P39748 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FEN1P39748 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FEN1P39748 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FEN1P39748 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FEN1P39748 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FEN1P39748 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FEN1P39748 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
FEN1P39748 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FEN1P39748 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FEN1P39748 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FEN1P39748 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FEN1P39748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FEN1P39748 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FEN1P39748 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FEN1P39748 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FEN1P39748 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FEN1P39748 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FEN1P39748 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FEN1P39748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FEN1P39748 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FEN1P39748 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FEN1P39748 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
FEN1P39748 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FEN1P39748 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FEN1P39748 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FEN1P39748 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FEN1P39748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
FEN1P39748 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FEN1P39748 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
FEN1P39748 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FEN1P39748 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FEN1P39748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FEN1P39748 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FEN1P39748 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FEN1P39748 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FEN1P39748 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FEN1P39748 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FEN1P39748 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FEN1P39748 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FEN1P39748 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FEN1P39748 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEN1P39748 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FEN1P39748 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FEN1P39748 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FEN1P39748 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FEN1P39748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FEN1P39748 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FEN1P39748 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FEN1P39748 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FEN1P39748 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FEN1P39748 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEN1P39748 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FEN1P39748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FEN1P39748 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FEN1P39748 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FEN1P39748 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FEN1P39748 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FEN1P39748 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEN1P39748 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEN1P39748 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEN1P39748 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FEN1P39748 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FEN1P39748 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FEN1P39748 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FEN1P39748 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FEN1P39748 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FEN1P39748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FEN1P39748 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FEN1P39748 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEN1P39748 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEN1P39748 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FEN1P39748 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FEN1P39748 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FEN1P39748 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FEN1P39748 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FEN1P39748 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEN1P39748 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEN1P39748 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEN1P39748 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FEN1P39748 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FEN1P39748 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms