Protein–RNA interactions for Protein: P39059

COL15A1, Collagen alpha-1(XV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL15A1P39059 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
COL15A1P39059 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
COL15A1P39059 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
COL15A1P39059 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
COL15A1P39059 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.2
COL15A1P39059 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
COL15A1P39059 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
COL15A1P39059 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
COL15A1P39059 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
COL15A1P39059 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
COL15A1P39059 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL15A1P39059 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL15A1P39059 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
COL15A1P39059 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
COL15A1P39059 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
COL15A1P39059 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL15A1P39059 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
COL15A1P39059 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
COL15A1P39059 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
COL15A1P39059 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
COL15A1P39059 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
COL15A1P39059 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
COL15A1P39059 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL15A1P39059 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
COL15A1P39059 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.15
COL15A1P39059 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.7■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
COL15A1P39059 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC34.59■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
COL15A1P39059 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
COL15A1P39059 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
COL15A1P39059 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL15A1P39059 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
COL15A1P39059 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
COL15A1P39059 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
COL15A1P39059 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms