Protein–RNA interactions for Protein: P37088

SCNN1A, Amiloride-sensitive sodium channel subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1AP37088 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCNN1AP37088 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCNN1AP37088 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCNN1AP37088 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCNN1AP37088 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCNN1AP37088 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCNN1AP37088 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCNN1AP37088 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SCNN1AP37088 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SCNN1AP37088 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SCNN1AP37088 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms