Protein–RNA interactions for Protein: P35557

GCK, Glucokinase, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCKP35557 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GCKP35557 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCKP35557 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GCKP35557 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCKP35557 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GCKP35557 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCKP35557 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCKP35557 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GCKP35557 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCKP35557 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCKP35557 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCKP35557 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCKP35557 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GCKP35557 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GCKP35557 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCKP35557 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GCKP35557 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GCKP35557 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCKP35557 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCKP35557 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
GCKP35557 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GCKP35557 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCKP35557 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GCKP35557 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCKP35557 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCKP35557 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GCKP35557 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GCKP35557 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCKP35557 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GCKP35557 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCKP35557 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GCKP35557 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCKP35557 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCKP35557 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCKP35557 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GCKP35557 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCKP35557 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCKP35557 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCKP35557 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GCKP35557 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCKP35557 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCKP35557 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCKP35557 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GCKP35557 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GCKP35557 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCKP35557 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCKP35557 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCKP35557 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GCKP35557 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GCKP35557 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCKP35557 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GCKP35557 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GCKP35557 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCKP35557 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GCKP35557 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GCKP35557 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCKP35557 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GCKP35557 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCKP35557 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GCKP35557 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCKP35557 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCKP35557 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCKP35557 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCKP35557 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCKP35557 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCKP35557 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCKP35557 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCKP35557 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCKP35557 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCKP35557 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCKP35557 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCKP35557 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCKP35557 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCKP35557 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCKP35557 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCKP35557 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCKP35557 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCKP35557 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCKP35557 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCKP35557 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCKP35557 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCKP35557 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCKP35557 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCKP35557 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCKP35557 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
GCKP35557 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCKP35557 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCKP35557 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCKP35557 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCKP35557 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GCKP35557 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCKP35557 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GCKP35557 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCKP35557 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCKP35557 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GCKP35557 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
GCKP35557 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCKP35557 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GCKP35557 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GCKP35557 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms