Protein–RNA interactions for Protein: P35408

PTGER4, Prostaglandin E2 receptor EP4 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER4P35408 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PTGER4P35408 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PTGER4P35408 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTGER4P35408 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PTGER4P35408 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGER4P35408 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER4P35408 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER4P35408 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms