Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 GNAS-238ENST00000480975 1534 ntTSL 520.87■□□□□ 0.932e-9■■■■■ 69.5
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GTF2F1P35269 GNAS-230ENST00000472183 911 ntTSL 320.26■□□□□ 0.832e-9■■■■■ 69.5
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GTF2F1P35269 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.513e-13■■■■■ 66.8
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GTF2F1P35269 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.682e-16■■■■■ 66.6
GTF2F1P35269 EEF1AKMT2-203ENST00000466270 3587 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.472e-16■■■■■ 66.6
GTF2F1P35269 TMEM63A-202ENST00000436966 454 ntTSL 216.14■□□□□ 0.172e-16■■■■■ 66.6
GTF2F1P35269 AC068896.1-201ENST00000494792 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.152e-16■■■■■ 66.6
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GTF2F1P35269 LARP4-214ENST00000548993 790 ntTSL 518.36■□□□□ 0.535e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.265e-11■■■■■ 66.1
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GTF2F1P35269 LARP4-213ENST00000548697 587 ntTSL 515.27■□□□□ 0.045e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.145e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-205ENST00000517559 559 ntTSL 412.48□□□□□ -0.415e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-211ENST00000523389 588 ntTSL 311.23□□□□□ -0.615e-11■■■■■ 66.1
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GTF2F1P35269 LARP4-216ENST00000550522 567 ntTSL 46.27□□□□□ -1.415e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 LARP4-215ENST00000550260 583 ntTSL 34.58□□□□□ -1.685e-11■■■■■ 66.1
GTF2F1P35269 TFG-205ENST00000479672 776 ntTSL 325.92■■□□□ 1.744e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.494e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.34e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-208ENST00000490574 1696 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.14e-9■■■■■ 65.9
GTF2F1P35269 TFG-202ENST00000418917 1716 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.244e-9■■■■■ 65.9
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