Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
CDH5P33151 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CDH5P33151 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH5P33151 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH5P33151 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH5P33151 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH5P33151 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CDH5P33151 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDH5P33151 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CDH5P33151 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH5P33151 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH5P33151 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CDH5P33151 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH5P33151 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CDH5P33151 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CDH5P33151 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH5P33151 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CDH5P33151 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CDH5P33151 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH5P33151 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH5P33151 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDH5P33151 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDH5P33151 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH5P33151 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH5P33151 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDH5P33151 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDH5P33151 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDH5P33151 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH5P33151 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH5P33151 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDH5P33151 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDH5P33151 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CDH5P33151 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDH5P33151 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDH5P33151 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDH5P33151 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CDH5P33151 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDH5P33151 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDH5P33151 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH5P33151 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH5P33151 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH5P33151 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH5P33151 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDH5P33151 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDH5P33151 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDH5P33151 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDH5P33151 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDH5P33151 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDH5P33151 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDH5P33151 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDH5P33151 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CDH5P33151 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDH5P33151 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CDH5P33151 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDH5P33151 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDH5P33151 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH5P33151 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH5P33151 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH5P33151 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDH5P33151 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH5P33151 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH5P33151 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
CDH5P33151 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH5P33151 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDH5P33151 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH5P33151 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH5P33151 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH5P33151 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDH5P33151 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDH5P33151 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDH5P33151 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDH5P33151 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDH5P33151 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
CDH5P33151 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH5P33151 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH5P33151 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDH5P33151 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH5P33151 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDH5P33151 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH5P33151 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDH5P33151 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH5P33151 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDH5P33151 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDH5P33151 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH5P33151 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDH5P33151 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CDH5P33151 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH5P33151 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH5P33151 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH5P33151 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDH5P33151 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH5P33151 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH5P33151 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDH5P33151 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH5P33151 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH5P33151 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDH5P33151 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH5P33151 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDH5P33151 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDH5P33151 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms