Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
IFNA8P32881 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
IFNA8P32881 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IFNA8P32881 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IFNA8P32881 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IFNA8P32881 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IFNA8P32881 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IFNA8P32881 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFNA8P32881 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms