Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CLIP1P30622 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CLIP1P30622 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CLIP1P30622 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CLIP1P30622 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
CLIP1P30622 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CLIP1P30622 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CLIP1P30622 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
CLIP1P30622 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
CLIP1P30622 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CLIP1P30622 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
CLIP1P30622 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC43.63■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.62■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC43.6■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CLIP1P30622 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CLIP1P30622 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CLIP1P30622 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
CLIP1P30622 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CLIP1P30622 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CLIP1P30622 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CLIP1P30622 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
CLIP1P30622 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CLIP1P30622 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CLIP1P30622 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CLIP1P30622 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
CLIP1P30622 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CLIP1P30622 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CLIP1P30622 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
CLIP1P30622 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CLIP1P30622 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
CLIP1P30622 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
CLIP1P30622 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC43.24■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
CLIP1P30622 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
CLIP1P30622 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CLIP1P30622 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
CLIP1P30622 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CLIP1P30622 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
CLIP1P30622 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
CLIP1P30622 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
CLIP1P30622 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
CLIP1P30622 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
CLIP1P30622 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
CLIP1P30622 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.06■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.05■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC43.04■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC43.02■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.01■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
CLIP1P30622 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
CLIP1P30622 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.93■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms