Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
LMOD1P29536 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD1P29536 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD1P29536 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
LMOD1P29536 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
LMOD1P29536 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
LMOD1P29536 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
LMOD1P29536 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
LMOD1P29536 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
LMOD1P29536 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
LMOD1P29536 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
LMOD1P29536 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
LMOD1P29536 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD1P29536 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
LMOD1P29536 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
LMOD1P29536 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
LMOD1P29536 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
LMOD1P29536 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
LMOD1P29536 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
LMOD1P29536 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
LMOD1P29536 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.88■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
LMOD1P29536 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms