Protein–RNA interactions for Protein: P27708

CAD, CAD protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADP27708 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CADP27708 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CADP27708 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CADP27708 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CADP27708 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CADP27708 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADP27708 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADP27708 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CADP27708 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADP27708 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADP27708 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CADP27708 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CADP27708 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CADP27708 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CADP27708 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CADP27708 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CADP27708 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CADP27708 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CADP27708 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CADP27708 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CADP27708 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADP27708 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADP27708 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CADP27708 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADP27708 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CADP27708 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADP27708 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADP27708 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CADP27708 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADP27708 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADP27708 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CADP27708 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CADP27708 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CADP27708 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADP27708 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CADP27708 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADP27708 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CADP27708 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CADP27708 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CADP27708 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADP27708 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADP27708 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CADP27708 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADP27708 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CADP27708 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADP27708 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CADP27708 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CADP27708 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADP27708 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CADP27708 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CADP27708 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CADP27708 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADP27708 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CADP27708 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADP27708 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADP27708 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CADP27708 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CADP27708 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CADP27708 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CADP27708 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADP27708 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADP27708 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADP27708 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADP27708 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CADP27708 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADP27708 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADP27708 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CADP27708 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADP27708 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CADP27708 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADP27708 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CADP27708 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADP27708 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADP27708 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CADP27708 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADP27708 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CADP27708 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CADP27708 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADP27708 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADP27708 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADP27708 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADP27708 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CADP27708 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADP27708 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADP27708 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADP27708 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADP27708 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CADP27708 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CADP27708 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADP27708 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADP27708 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CADP27708 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CADP27708 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CADP27708 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CADP27708 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CADP27708 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CADP27708 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CADP27708 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CADP27708 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CADP27708 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms