Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO1P25800 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LMO1P25800 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LMO1P25800 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO1P25800 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LMO1P25800 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMO1P25800 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LMO1P25800 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO1P25800 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LMO1P25800 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LMO1P25800 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO1P25800 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LMO1P25800 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO1P25800 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO1P25800 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO1P25800 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LMO1P25800 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LMO1P25800 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LMO1P25800 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO1P25800 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LMO1P25800 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO1P25800 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO1P25800 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LMO1P25800 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMO1P25800 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO1P25800 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO1P25800 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMO1P25800 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMO1P25800 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMO1P25800 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMO1P25800 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO1P25800 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO1P25800 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMO1P25800 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMO1P25800 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO1P25800 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO1P25800 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMO1P25800 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO1P25800 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO1P25800 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMO1P25800 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMO1P25800 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO1P25800 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMO1P25800 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO1P25800 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO1P25800 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO1P25800 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO1P25800 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO1P25800 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMO1P25800 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO1P25800 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMO1P25800 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMO1P25800 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO1P25800 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO1P25800 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LMO1P25800 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO1P25800 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LMO1P25800 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LMO1P25800 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LMO1P25800 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO1P25800 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO1P25800 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LMO1P25800 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO1P25800 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LMO1P25800 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO1P25800 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO1P25800 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LMO1P25800 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO1P25800 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LMO1P25800 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO1P25800 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO1P25800 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO1P25800 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LMO1P25800 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO1P25800 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LMO1P25800 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO1P25800 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO1P25800 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO1P25800 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO1P25800 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LMO1P25800 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO1P25800 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LMO1P25800 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO1P25800 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO1P25800 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO1P25800 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LMO1P25800 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO1P25800 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO1P25800 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO1P25800 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO1P25800 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMO1P25800 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO1P25800 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO1P25800 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMO1P25800 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO1P25800 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMO1P25800 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMO1P25800 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO1P25800 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMO1P25800 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.3 ms