Protein–RNA interactions for Protein: P23610

F8A1, Factor VIII intron 22 protein, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8A1P23610 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8A1P23610 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8A1P23610 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
F8A1P23610 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
F8A1P23610 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F8A1P23610 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
F8A1P23610 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8A1P23610 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
F8A1P23610 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8A1P23610 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
F8A1P23610 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8A1P23610 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8A1P23610 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
F8A1P23610 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
F8A1P23610 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
F8A1P23610 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8A1P23610 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
F8A1P23610 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
F8A1P23610 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
F8A1P23610 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
F8A1P23610 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
F8A1P23610 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
F8A1P23610 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8A1P23610 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8A1P23610 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
F8A1P23610 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8A1P23610 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
F8A1P23610 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
F8A1P23610 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8A1P23610 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8A1P23610 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8A1P23610 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8A1P23610 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8A1P23610 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
F8A1P23610 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
F8A1P23610 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8A1P23610 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
F8A1P23610 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8A1P23610 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8A1P23610 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
F8A1P23610 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
F8A1P23610 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
F8A1P23610 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
F8A1P23610 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
F8A1P23610 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
F8A1P23610 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8A1P23610 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8A1P23610 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
F8A1P23610 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8A1P23610 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8A1P23610 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
F8A1P23610 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8A1P23610 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
F8A1P23610 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8A1P23610 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8A1P23610 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8A1P23610 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8A1P23610 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8A1P23610 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
F8A1P23610 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
F8A1P23610 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8A1P23610 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8A1P23610 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8A1P23610 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8A1P23610 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8A1P23610 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
F8A1P23610 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
F8A1P23610 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8A1P23610 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8A1P23610 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
F8A1P23610 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
F8A1P23610 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
F8A1P23610 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
F8A1P23610 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F8A1P23610 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F8A1P23610 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F8A1P23610 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
F8A1P23610 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8A1P23610 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8A1P23610 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8A1P23610 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8A1P23610 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8A1P23610 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8A1P23610 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
F8A1P23610 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8A1P23610 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
F8A1P23610 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8A1P23610 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8A1P23610 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8A1P23610 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
F8A1P23610 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8A1P23610 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
F8A1P23610 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8A1P23610 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
F8A1P23610 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8A1P23610 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8A1P23610 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
F8A1P23610 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8A1P23610 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
F8A1P23610 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms