Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
ITGA6P23229 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ITGA6P23229 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGA6P23229 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGA6P23229 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
ITGA6P23229 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ITGA6P23229 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGA6P23229 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
ITGA6P23229 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ITGA6P23229 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ITGA6P23229 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ITGA6P23229 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ITGA6P23229 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
ITGA6P23229 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGA6P23229 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ITGA6P23229 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ITGA6P23229 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ITGA6P23229 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGA6P23229 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
ITGA6P23229 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ITGA6P23229 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
ITGA6P23229 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
ITGA6P23229 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGA6P23229 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ITGA6P23229 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
ITGA6P23229 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ITGA6P23229 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ITGA6P23229 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ITGA6P23229 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC33.51■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ITGA6P23229 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ITGA6P23229 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ITGA6P23229 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms