Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CA4P22748 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CA4P22748 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CA4P22748 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CA4P22748 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CA4P22748 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CA4P22748 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CA4P22748 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CA4P22748 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CA4P22748 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CA4P22748 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CA4P22748 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CA4P22748 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CA4P22748 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CA4P22748 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA4P22748 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA4P22748 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA4P22748 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CA4P22748 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CA4P22748 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CA4P22748 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CA4P22748 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CA4P22748 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CA4P22748 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CA4P22748 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CA4P22748 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CA4P22748 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CA4P22748 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CA4P22748 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CA4P22748 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CA4P22748 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CA4P22748 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CA4P22748 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CA4P22748 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CA4P22748 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CA4P22748 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CA4P22748 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CA4P22748 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CA4P22748 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CA4P22748 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CA4P22748 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CA4P22748 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CA4P22748 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CA4P22748 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CA4P22748 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CA4P22748 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CA4P22748 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CA4P22748 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CA4P22748 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CA4P22748 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CA4P22748 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CA4P22748 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CA4P22748 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CA4P22748 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CA4P22748 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CA4P22748 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CA4P22748 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CA4P22748 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CA4P22748 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CA4P22748 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CA4P22748 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CA4P22748 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CA4P22748 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.53■■■□□ 2
CA4P22748 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CA4P22748 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CA4P22748 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CA4P22748 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CA4P22748 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CA4P22748 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CA4P22748 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CA4P22748 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CA4P22748 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CA4P22748 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CA4P22748 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CA4P22748 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CA4P22748 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CA4P22748 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CA4P22748 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CA4P22748 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CA4P22748 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CA4P22748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CA4P22748 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CA4P22748 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
CA4P22748 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CA4P22748 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CA4P22748 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CA4P22748 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CA4P22748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CA4P22748 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CA4P22748 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CA4P22748 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CA4P22748 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CA4P22748 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CA4P22748 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CA4P22748 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CA4P22748 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CA4P22748 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CA4P22748 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CA4P22748 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CA4P22748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms