Protein–RNA interactions for Protein: P22735

TGM1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM1P22735 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGM1P22735 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGM1P22735 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TGM1P22735 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TGM1P22735 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TGM1P22735 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
TGM1P22735 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGM1P22735 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TGM1P22735 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TGM1P22735 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TGM1P22735 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TGM1P22735 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGM1P22735 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TGM1P22735 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TGM1P22735 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TGM1P22735 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TGM1P22735 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGM1P22735 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGM1P22735 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TGM1P22735 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGM1P22735 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGM1P22735 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TGM1P22735 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGM1P22735 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGM1P22735 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TGM1P22735 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TGM1P22735 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TGM1P22735 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGM1P22735 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TGM1P22735 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TGM1P22735 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGM1P22735 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TGM1P22735 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
TGM1P22735 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGM1P22735 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TGM1P22735 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGM1P22735 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TGM1P22735 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TGM1P22735 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TGM1P22735 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TGM1P22735 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TGM1P22735 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TGM1P22735 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TGM1P22735 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGM1P22735 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TGM1P22735 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TGM1P22735 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGM1P22735 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TGM1P22735 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGM1P22735 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TGM1P22735 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGM1P22735 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TGM1P22735 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGM1P22735 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGM1P22735 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TGM1P22735 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TGM1P22735 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TGM1P22735 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGM1P22735 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TGM1P22735 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TGM1P22735 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGM1P22735 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TGM1P22735 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGM1P22735 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TGM1P22735 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TGM1P22735 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TGM1P22735 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TGM1P22735 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TGM1P22735 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TGM1P22735 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
TGM1P22735 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TGM1P22735 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TGM1P22735 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TGM1P22735 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TGM1P22735 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TGM1P22735 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TGM1P22735 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
TGM1P22735 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TGM1P22735 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TGM1P22735 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TGM1P22735 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TGM1P22735 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TGM1P22735 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TGM1P22735 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TGM1P22735 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TGM1P22735 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TGM1P22735 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TGM1P22735 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TGM1P22735 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TGM1P22735 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TGM1P22735 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TGM1P22735 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TGM1P22735 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGM1P22735 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGM1P22735 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGM1P22735 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGM1P22735 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TGM1P22735 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TGM1P22735 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TGM1P22735 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms