Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SCP2P22307 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCP2P22307 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SCP2P22307 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCP2P22307 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCP2P22307 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SCP2P22307 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCP2P22307 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCP2P22307 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCP2P22307 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCP2P22307 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCP2P22307 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SCP2P22307 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
SCP2P22307 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCP2P22307 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCP2P22307 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCP2P22307 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCP2P22307 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCP2P22307 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCP2P22307 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SCP2P22307 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SCP2P22307 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SCP2P22307 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SCP2P22307 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SCP2P22307 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SCP2P22307 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
SCP2P22307 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SCP2P22307 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCP2P22307 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SCP2P22307 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCP2P22307 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCP2P22307 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SCP2P22307 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
SCP2P22307 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SCP2P22307 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCP2P22307 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SCP2P22307 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCP2P22307 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SCP2P22307 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCP2P22307 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCP2P22307 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
SCP2P22307 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCP2P22307 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SCP2P22307 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SCP2P22307 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCP2P22307 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCP2P22307 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCP2P22307 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCP2P22307 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCP2P22307 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCP2P22307 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCP2P22307 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCP2P22307 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCP2P22307 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCP2P22307 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCP2P22307 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCP2P22307 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCP2P22307 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCP2P22307 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCP2P22307 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCP2P22307 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SCP2P22307 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCP2P22307 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCP2P22307 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCP2P22307 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCP2P22307 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCP2P22307 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCP2P22307 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCP2P22307 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCP2P22307 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SCP2P22307 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCP2P22307 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SCP2P22307 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SCP2P22307 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SCP2P22307 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SCP2P22307 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCP2P22307 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SCP2P22307 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCP2P22307 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCP2P22307 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCP2P22307 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SCP2P22307 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCP2P22307 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCP2P22307 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SCP2P22307 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCP2P22307 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCP2P22307 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SCP2P22307 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCP2P22307 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCP2P22307 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCP2P22307 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SCP2P22307 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SCP2P22307 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCP2P22307 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SCP2P22307 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCP2P22307 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SCP2P22307 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCP2P22307 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SCP2P22307 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SCP2P22307 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms