Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VDAC1P21796 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VDAC1P21796 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VDAC1P21796 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VDAC1P21796 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VDAC1P21796 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
VDAC1P21796 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VDAC1P21796 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VDAC1P21796 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms