Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HNF1AP20823 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HNF1AP20823 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HNF1AP20823 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HNF1AP20823 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HNF1AP20823 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HNF1AP20823 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HNF1AP20823 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms