Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFE3P19532 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFE3P19532 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFE3P19532 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFE3P19532 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFE3P19532 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFE3P19532 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TFE3P19532 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFE3P19532 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFE3P19532 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFE3P19532 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFE3P19532 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFE3P19532 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TFE3P19532 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TFE3P19532 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFE3P19532 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFE3P19532 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFE3P19532 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFE3P19532 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFE3P19532 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFE3P19532 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFE3P19532 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFE3P19532 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFE3P19532 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFE3P19532 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TFE3P19532 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
TFE3P19532 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFE3P19532 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFE3P19532 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFE3P19532 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFE3P19532 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFE3P19532 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFE3P19532 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFE3P19532 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFE3P19532 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFE3P19532 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFE3P19532 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFE3P19532 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TFE3P19532 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFE3P19532 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFE3P19532 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFE3P19532 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFE3P19532 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFE3P19532 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFE3P19532 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFE3P19532 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFE3P19532 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFE3P19532 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFE3P19532 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFE3P19532 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFE3P19532 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TFE3P19532 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFE3P19532 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
TFE3P19532 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFE3P19532 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFE3P19532 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFE3P19532 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFE3P19532 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFE3P19532 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TFE3P19532 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFE3P19532 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TFE3P19532 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFE3P19532 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFE3P19532 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFE3P19532 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFE3P19532 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFE3P19532 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TFE3P19532 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFE3P19532 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TFE3P19532 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TFE3P19532 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TFE3P19532 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TFE3P19532 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFE3P19532 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFE3P19532 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TFE3P19532 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFE3P19532 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TFE3P19532 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFE3P19532 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFE3P19532 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TFE3P19532 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFE3P19532 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TFE3P19532 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TFE3P19532 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFE3P19532 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFE3P19532 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFE3P19532 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFE3P19532 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFE3P19532 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TFE3P19532 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TFE3P19532 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFE3P19532 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TFE3P19532 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TFE3P19532 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TFE3P19532 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFE3P19532 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TFE3P19532 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFE3P19532 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFE3P19532 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TFE3P19532 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms