Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD53P19397 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD53P19397 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CD53P19397 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CD53P19397 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CD53P19397 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD53P19397 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD53P19397 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD53P19397 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CD53P19397 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD53P19397 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD53P19397 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CD53P19397 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD53P19397 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CD53P19397 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD53P19397 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD53P19397 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD53P19397 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CD53P19397 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CD53P19397 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD53P19397 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD53P19397 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CD53P19397 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD53P19397 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD53P19397 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CD53P19397 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CD53P19397 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD53P19397 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CD53P19397 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD53P19397 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD53P19397 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD53P19397 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CD53P19397 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CD53P19397 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
CD53P19397 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD53P19397 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CD53P19397 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CD53P19397 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD53P19397 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD53P19397 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CD53P19397 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD53P19397 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CD53P19397 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD53P19397 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD53P19397 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CD53P19397 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD53P19397 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CD53P19397 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CD53P19397 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CD53P19397 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CD53P19397 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CD53P19397 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD53P19397 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD53P19397 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD53P19397 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CD53P19397 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CD53P19397 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD53P19397 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD53P19397 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CD53P19397 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CD53P19397 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD53P19397 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD53P19397 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CD53P19397 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CD53P19397 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD53P19397 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD53P19397 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD53P19397 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD53P19397 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD53P19397 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CD53P19397 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CD53P19397 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD53P19397 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD53P19397 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD53P19397 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CD53P19397 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CD53P19397 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD53P19397 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD53P19397 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD53P19397 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD53P19397 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CD53P19397 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD53P19397 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CD53P19397 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CD53P19397 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CD53P19397 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD53P19397 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD53P19397 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD53P19397 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD53P19397 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CD53P19397 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD53P19397 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD53P19397 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CD53P19397 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD53P19397 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CD53P19397 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CD53P19397 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD53P19397 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD53P19397 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CD53P19397 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms