Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EGR1P18146 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGR1P18146 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EGR1P18146 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGR1P18146 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
EGR1P18146 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGR1P18146 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
EGR1P18146 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
EGR1P18146 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGR1P18146 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
EGR1P18146 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
EGR1P18146 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
EGR1P18146 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
EGR1P18146 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
EGR1P18146 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGR1P18146 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGR1P18146 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGR1P18146 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
EGR1P18146 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGR1P18146 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
EGR1P18146 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR1P18146 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR1P18146 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR1P18146 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGR1P18146 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGR1P18146 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGR1P18146 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGR1P18146 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGR1P18146 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGR1P18146 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGR1P18146 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR1P18146 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR1P18146 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
EGR1P18146 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EGR1P18146 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGR1P18146 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGR1P18146 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGR1P18146 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EGR1P18146 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EGR1P18146 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGR1P18146 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGR1P18146 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
EGR1P18146 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EGR1P18146 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EGR1P18146 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGR1P18146 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGR1P18146 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGR1P18146 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EGR1P18146 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
EGR1P18146 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGR1P18146 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGR1P18146 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EGR1P18146 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGR1P18146 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGR1P18146 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EGR1P18146 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGR1P18146 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGR1P18146 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
EGR1P18146 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
EGR1P18146 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGR1P18146 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGR1P18146 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGR1P18146 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGR1P18146 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGR1P18146 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
EGR1P18146 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGR1P18146 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGR1P18146 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGR1P18146 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
EGR1P18146 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EGR1P18146 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
EGR1P18146 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGR1P18146 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGR1P18146 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGR1P18146 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EGR1P18146 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGR1P18146 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EGR1P18146 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGR1P18146 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EGR1P18146 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGR1P18146 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGR1P18146 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EGR1P18146 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGR1P18146 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGR1P18146 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGR1P18146 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGR1P18146 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EGR1P18146 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR1P18146 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR1P18146 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EGR1P18146 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGR1P18146 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EGR1P18146 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EGR1P18146 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR1P18146 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR1P18146 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR1P18146 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EGR1P18146 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGR1P18146 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EGR1P18146 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms