Protein–RNA interactions for Protein: P17858

PFKL, ATP-dependent 6-phosphofructokinase, liver type, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKLP17858 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PFKLP17858 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PFKLP17858 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PFKLP17858 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PFKLP17858 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKLP17858 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKLP17858 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKLP17858 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKLP17858 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKLP17858 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PFKLP17858 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKLP17858 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PFKLP17858 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PFKLP17858 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKLP17858 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKLP17858 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PFKLP17858 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKLP17858 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PFKLP17858 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKLP17858 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKLP17858 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PFKLP17858 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PFKLP17858 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKLP17858 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKLP17858 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKLP17858 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PFKLP17858 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKLP17858 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKLP17858 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PFKLP17858 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PFKLP17858 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKLP17858 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKLP17858 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PFKLP17858 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PFKLP17858 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PFKLP17858 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PFKLP17858 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PFKLP17858 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PFKLP17858 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PFKLP17858 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKLP17858 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKLP17858 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PFKLP17858 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKLP17858 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKLP17858 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PFKLP17858 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKLP17858 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKLP17858 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKLP17858 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PFKLP17858 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKLP17858 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PFKLP17858 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKLP17858 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PFKLP17858 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKLP17858 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PFKLP17858 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PFKLP17858 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PFKLP17858 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PFKLP17858 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PFKLP17858 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKLP17858 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKLP17858 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PFKLP17858 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PFKLP17858 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKLP17858 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKLP17858 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKLP17858 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKLP17858 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PFKLP17858 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKLP17858 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKLP17858 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PFKLP17858 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PFKLP17858 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKLP17858 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKLP17858 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PFKLP17858 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKLP17858 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKLP17858 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PFKLP17858 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKLP17858 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PFKLP17858 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PFKLP17858 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKLP17858 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PFKLP17858 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PFKLP17858 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKLP17858 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKLP17858 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKLP17858 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PFKLP17858 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKLP17858 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKLP17858 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKLP17858 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PFKLP17858 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PFKLP17858 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PFKLP17858 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKLP17858 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKLP17858 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKLP17858 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKLP17858 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PFKLP17858 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms