Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXB8P17481 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXB8P17481 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HOXB8P17481 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
HOXB8P17481 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
HOXB8P17481 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
HOXB8P17481 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
HOXB8P17481 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
HOXB8P17481 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
HOXB8P17481 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
HOXB8P17481 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB8P17481 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
HOXB8P17481 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HOXB8P17481 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB8P17481 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB8P17481 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
HOXB8P17481 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
HOXB8P17481 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOXB8P17481 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOXB8P17481 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOXB8P17481 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms