Protein–RNA interactions for Protein: P17019

ZNF708, Zinc finger protein 708, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF708P17019 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF708P17019 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF708P17019 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF708P17019 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF708P17019 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF708P17019 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF708P17019 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF708P17019 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF708P17019 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF708P17019 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF708P17019 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF708P17019 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF708P17019 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZNF708P17019 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZNF708P17019 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZNF708P17019 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZNF708P17019 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF708P17019 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF708P17019 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZNF708P17019 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF708P17019 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms