Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IL7RP16871 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IL7RP16871 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IL7RP16871 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IL7RP16871 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IL7RP16871 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IL7RP16871 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IL7RP16871 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IL7RP16871 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
IL7RP16871 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
IL7RP16871 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IL7RP16871 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
IL7RP16871 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IL7RP16871 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IL7RP16871 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IL7RP16871 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IL7RP16871 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
IL7RP16871 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IL7RP16871 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IL7RP16871 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IL7RP16871 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IL7RP16871 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
IL7RP16871 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IL7RP16871 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IL7RP16871 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IL7RP16871 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IL7RP16871 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IL7RP16871 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IL7RP16871 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IL7RP16871 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IL7RP16871 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IL7RP16871 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IL7RP16871 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IL7RP16871 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IL7RP16871 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IL7RP16871 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL7RP16871 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL7RP16871 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL7RP16871 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL7RP16871 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL7RP16871 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IL7RP16871 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IL7RP16871 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IL7RP16871 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IL7RP16871 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IL7RP16871 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IL7RP16871 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IL7RP16871 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IL7RP16871 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL7RP16871 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IL7RP16871 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL7RP16871 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IL7RP16871 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
IL7RP16871 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IL7RP16871 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL7RP16871 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL7RP16871 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IL7RP16871 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
IL7RP16871 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IL7RP16871 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IL7RP16871 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IL7RP16871 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL7RP16871 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
IL7RP16871 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL7RP16871 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IL7RP16871 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL7RP16871 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL7RP16871 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
IL7RP16871 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL7RP16871 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL7RP16871 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
IL7RP16871 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
IL7RP16871 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IL7RP16871 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL7RP16871 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
IL7RP16871 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IL7RP16871 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
IL7RP16871 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL7RP16871 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL7RP16871 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL7RP16871 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL7RP16871 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
IL7RP16871 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
IL7RP16871 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IL7RP16871 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
IL7RP16871 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL7RP16871 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
IL7RP16871 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IL7RP16871 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IL7RP16871 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IL7RP16871 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
IL7RP16871 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
IL7RP16871 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
IL7RP16871 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IL7RP16871 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
IL7RP16871 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IL7RP16871 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IL7RP16871 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IL7RP16871 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
IL7RP16871 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms