Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT5P13647 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT5P13647 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT5P13647 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT5P13647 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT5P13647 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT5P13647 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT5P13647 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT5P13647 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT5P13647 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT5P13647 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT5P13647 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
KRT5P13647 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT5P13647 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT5P13647 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
KRT5P13647 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT5P13647 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
KRT5P13647 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT5P13647 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
KRT5P13647 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT5P13647 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
KRT5P13647 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
KRT5P13647 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
KRT5P13647 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT5P13647 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
KRT5P13647 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
KRT5P13647 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT5P13647 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT5P13647 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT5P13647 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
KRT5P13647 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
KRT5P13647 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT5P13647 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
KRT5P13647 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT5P13647 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
KRT5P13647 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
KRT5P13647 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT5P13647 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
KRT5P13647 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
KRT5P13647 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT5P13647 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT5P13647 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT5P13647 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT5P13647 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
KRT5P13647 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
KRT5P13647 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT5P13647 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KRT5P13647 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT5P13647 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT5P13647 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT5P13647 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KRT5P13647 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT5P13647 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT5P13647 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT5P13647 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KRT5P13647 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT5P13647 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KRT5P13647 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KRT5P13647 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KRT5P13647 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
KRT5P13647 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT5P13647 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
KRT5P13647 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT5P13647 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT5P13647 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KRT5P13647 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT5P13647 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KRT5P13647 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT5P13647 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT5P13647 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KRT5P13647 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT5P13647 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KRT5P13647 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT5P13647 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KRT5P13647 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT5P13647 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT5P13647 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KRT5P13647 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT5P13647 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT5P13647 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT5P13647 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT5P13647 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KRT5P13647 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT5P13647 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT5P13647 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KRT5P13647 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KRT5P13647 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT5P13647 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT5P13647 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
KRT5P13647 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT5P13647 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT5P13647 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KRT5P13647 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT5P13647 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KRT5P13647 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KRT5P13647 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT5P13647 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT5P13647 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT5P13647 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT5P13647 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms