Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ACTN1P12814 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ACTN1P12814 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
ACTN1P12814 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ACTN1P12814 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACTN1P12814 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ACTN1P12814 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ACTN1P12814 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ACTN1P12814 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ACTN1P12814 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN1P12814 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
ACTN1P12814 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ACTN1P12814 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ACTN1P12814 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ACTN1P12814 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ACTN1P12814 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms