Protein–RNA interactions for Protein: P11831

SRF, Serum response factor, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRFP11831 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRFP11831 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRFP11831 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRFP11831 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRFP11831 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRFP11831 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRFP11831 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRFP11831 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRFP11831 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SRFP11831 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRFP11831 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRFP11831 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRFP11831 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRFP11831 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRFP11831 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRFP11831 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRFP11831 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRFP11831 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRFP11831 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SRFP11831 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SRFP11831 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SRFP11831 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRFP11831 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SRFP11831 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SRFP11831 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRFP11831 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRFP11831 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SRFP11831 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SRFP11831 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRFP11831 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRFP11831 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRFP11831 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SRFP11831 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SRFP11831 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRFP11831 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SRFP11831 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SRFP11831 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SRFP11831 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRFP11831 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SRFP11831 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRFP11831 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SRFP11831 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SRFP11831 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRFP11831 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SRFP11831 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SRFP11831 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRFP11831 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SRFP11831 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SRFP11831 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRFP11831 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRFP11831 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRFP11831 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRFP11831 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRFP11831 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRFP11831 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRFP11831 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRFP11831 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRFP11831 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRFP11831 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRFP11831 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRFP11831 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRFP11831 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRFP11831 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRFP11831 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SRFP11831 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SRFP11831 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRFP11831 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SRFP11831 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SRFP11831 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SRFP11831 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SRFP11831 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRFP11831 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SRFP11831 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRFP11831 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SRFP11831 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SRFP11831 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SRFP11831 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRFP11831 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRFP11831 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SRFP11831 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SRFP11831 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SRFP11831 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRFP11831 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRFP11831 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SRFP11831 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SRFP11831 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SRFP11831 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
SRFP11831 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SRFP11831 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRFP11831 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRFP11831 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRFP11831 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRFP11831 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
SRFP11831 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SRFP11831 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRFP11831 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRFP11831 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
SRFP11831 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRFP11831 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SRFP11831 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms