Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
C8orf89P0DMQ9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
C8orf89P0DMQ9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
C8orf89P0DMQ9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
C8orf89P0DMQ9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
C8orf89P0DMQ9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
C8orf89P0DMQ9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
C8orf89P0DMQ9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
C8orf89P0DMQ9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
C8orf89P0DMQ9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
C8orf89P0DMQ9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
C8orf89P0DMQ9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
C8orf89P0DMQ9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C8orf89P0DMQ9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C8orf89P0DMQ9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms