Protein–RNA interactions for Protein: P0C860

MSL3P1, Putative male-specific lethal-3 protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3P1P0C860 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MSL3P1P0C860 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MSL3P1P0C860 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MSL3P1P0C860 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MSL3P1P0C860 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MSL3P1P0C860 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MSL3P1P0C860 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MSL3P1P0C860 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MSL3P1P0C860 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms