Protein–RNA interactions for Protein: P0C263

SBK2, Serine/threonine-protein kinase SBK2, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK2P0C263 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SBK2P0C263 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK2P0C263 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SBK2P0C263 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SBK2P0C263 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SBK2P0C263 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SBK2P0C263 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SBK2P0C263 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SBK2P0C263 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms