Protein–RNA interactions for Protein: P09430

TNP1, Spermatid nuclear transition protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP1P09430 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP1P09430 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP1P09430 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
TNP1P09430 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP1P09430 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP1P09430 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP1P09430 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP1P09430 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
TNP1P09430 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP1P09430 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
TNP1P09430 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP1P09430 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP1P09430 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP1P09430 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP1P09430 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
TNP1P09430 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP1P09430 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP1P09430 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
TNP1P09430 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP1P09430 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP1P09430 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
TNP1P09430 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP1P09430 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP1P09430 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP1P09430 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
TNP1P09430 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP1P09430 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
TNP1P09430 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP1P09430 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP1P09430 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP1P09430 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP1P09430 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP1P09430 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
TNP1P09430 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP1P09430 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP1P09430 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP1P09430 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP1P09430 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
TNP1P09430 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP1P09430 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP1P09430 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP1P09430 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
TNP1P09430 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP1P09430 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP1P09430 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP1P09430 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
TNP1P09430 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP1P09430 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP1P09430 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP1P09430 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP1P09430 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP1P09430 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TNP1P09430 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TNP1P09430 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP1P09430 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP1P09430 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP1P09430 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
TNP1P09430 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP1P09430 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP1P09430 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP1P09430 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP1P09430 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP1P09430 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
TNP1P09430 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP1P09430 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
TNP1P09430 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP1P09430 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP1P09430 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP1P09430 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
TNP1P09430 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP1P09430 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP1P09430 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
TNP1P09430 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
TNP1P09430 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP1P09430 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP1P09430 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP1P09430 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP1P09430 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
TNP1P09430 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP1P09430 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP1P09430 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP1P09430 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
TNP1P09430 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms